Integrated Genome Browser

소프트웨어 검토

통합 게놈 브라우저 (IGB)는 대형 게놈 데이터 세트를보고 탐색하는 데 사용되는 오픈 소스 프로그램입니다.

IGB를 사용하면 다양한 데이터 형식을보고 데이터와 상호 작용하고 그래프를 작성하고 이미지로 정보를 저장하고 공동 작업자와 데이터를 공유 할 수 있습니다. 이 프로그램은 FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband 및 GenBank와 같은 다양한 형식을 지원합니다. 데이터를 가져 와서 데이터 차이를 강조하기위한 불일치 그래프 및 적용 범위 표시를위한 깊이 그래프를 포함하여 다양한 그래프 형식으로 변환 할 수 있습니다. 또한 IGB의 확대 / 축소 및 패닝 애니메이션을 통해 데이터와 상호 작용할 수 있습니다.

IGB를 사용하면 간단한 디렉토리 시스템, 시퀀스 및 시각화를위한 기타 데이터 파일 인 QuickLoad 사이트에서 게놈에 액세스하고로드 할 수 있습니다. IGB는 스크립트 지원을 통해 기능 및 워크 플로 자동화를 추가하는 플러그인 지원 기능을 제공합니다. 또한 IGB는 고품질 JPEG, PNG 또는 SVG 이미지로 게시하거나 Dropbox에 데이터를 저장하여 데이터를 공유하는 고급 기능을 제공하여 공동 작업자가 프로젝트에 액세스 할 수 있도록합니다.

IGB는 주로 대학 연구원, 생물 학자, 생물 정보 학자들이 사용합니다. 다양한 게놈 데이터 형식을 열고, 데이터를 다른 그래프로 시각화하고, 공동 작업자와 데이터를 공유 할 수있는 고급 도구를 제공합니다. 불행하게도이 프로그램은 지속적인 개발을위한 보조금에 의존합니다. 즉, 언제든지 지원을 중단 할 수 있습니다. 그러나 Integrated Genome Browser는 여전히 게놈 데이터를 탐색하고 분석하려는 사용자를 위해 사용자 정의 가능한 프로그램입니다.

업데이트 : 2016 년 6 월 29 일

▶ 기본 파일 확장명

▶ 사용 된 다른 파일 확장명 Integrated Genome Browser 9