.cram 파일 확장명
파일 형식Compressed Alignment File
개발자 | EBI |
범주 | 데이터 파일 |
형식 | Binary |
.CRAM 옵션 번호
European Molecular Biology Laboratory의 외곽 인 EBI에서 개발 한 압축 정렬 파일 형식; BWA, BBMap 및 BLAT와 같은 짧은 판독 정렬 자로부터 생성 된 짧은 DNA 서열 판독 정렬을 저장한다.
CRAM 파일 형식은 BAM (Binary Alignment / Map) 파일 형식과 비슷하지만 더 나은 파일 압축과 재구성 된 열 기반 바이너리 컨테이너 형식을 제공합니다. 유전 소프트웨어 분야에서 데이터 량이 증가함에 따라 CRAM 형식은 정렬 데이터의 디스크 풋 프린트를 줄 이도록 설계되었습니다.
짧은 읽기 정렬은 서열이 게놈에서 오는 곳을 해독하는 과정입니다. 참조 게놈이 크기가 커서 참조 게놈에서 정확히 일치하는 것을 항상 찾고있는 것은 아니기 때문에 이것은 어려울 수 있습니다. 짧은 읽기 정렬 장치는 일치하는 항목과 거의 일치하는 항목을 검색하는 데 사용됩니다. 시퀀스가 너무 크기 때문에 CRAM과 같은 형식으로 제공되는 압축은 파일 크기를 관리하기에 필요합니다.
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